公司於2000年11月27日經中國監督管理委員會「證監發行字[2000]159號」文《關於核准南海發展股份有限公司公開發行的通知》核准，利用上海交易所交易系統，採用向原NET流通法人股股東定向配售和上網定價發行方式向社會公開發行人民幣普通股6500萬股，並於2000年12月25日在上海交易所上市。

根據中國監督管理委員會證監發行字[2000]159號文《關於核准南海發展股份有限公司公開發行的通知》和中國監督管理委員會證監發行字[1999]136號文《關於廣東省掛牌企業流通法人股清理方案的批覆》，公司內部職工股306.966萬股和原NET系統法人股6435萬股分別於2003年12月8日和2003年12月26日起上市流通。

公司2008年4月25日召開的2007年度股東大會決議通過2007 年度資本公積轉增股本方案，以2007年12月31日總股本20,851.42萬股為基數，以資本公積向全體股東每10股轉增3股，共轉增股份6,255.4251萬股，公司股份總數增至27,106.8419萬股。

公司2011年5月10日召開的2010年度股東大會決議通過2010 年度利潤分配方案，以2010 年12月31 日總股本 27,106.8419萬股為基數，向全體股東每10 股派發股利2股,共增加股份5,421.3684萬股，公司股份總數增至32,528.2103萬股，全部為無限售條件流通股份。

公司2012年3月26日召開的2011年度股東大會決議通過2011年度利潤分配方案，以2011年12月31日總股本325,282,103股為基數，以資本公積金按每股轉增0.5股的比例轉增股本，共增加股份16264.1052萬股，公司股份總數增至48792.3155萬股，全部為無限售條件流通股份。

2012年8月7日，公司通過非公開發行向廣東南海控股投資有限公司發行91,319,726 股（為有限售條件流通股，上市流通時間為2015年8月7日），公司總股本變更為579,242,881股。

根據中國證監會2014年12月11日印發的《關於核准bjl平台環境股份有限公司向創冠環保（香港）有限公司等發行股份購買資產並募集配套資金的批覆》（證監許可[2014]1336號），公司於2014年12月25日向創冠環保（香港）有限公司發行91019417股，收購創冠中國100%股權，向南海城投發行46534611股，收購燃氣發展30%的股權。股本變更為716796909股。

2015年2月，公司完成配套資金募集工作，向廣東省鹽業集團、廣東恆健資本管理有限公司、民生加銀基金管理有限公司、李貴山、長城國融投資管理有限公司共發行有限售條件流通股49467109股。公司股份總數增至766264018股。

2021年4月，公司完成可轉債公司債券贖回及摘牌工作，公司股份總數由發行前的766264018股增至815347146股。